Liste des fonctionnalités de Mycomètre 2.xx

Maj 8/12/2014

NB Il est possible que certaines fonctions aient été oubliées dans ce résumé déjà ancien

A ) POUR LES DEBUTANTS :

FONCTIONS DE MESURE BASIQUE (EN 2 CLICS)

Etalonnage simplifié

Mesure de spore 2D (Longueur, largeur)

Affichage des résultats

A lire : Mycomètre pour les nuls

B ) POUR FAIRE PLUS :

LES PRINCIPALES FONCTIONNALITES DE MYCOMETRE

Multilangues (FR It Es DE En-BS

(en préparation : Russe et Ukrainien)

Interface graphique

Affichage des références en plusieurs couleurs (paramétrable simplement et directement)

Pointage Bipoint ou "palmer" (apporte une grande précision et améliore l'ergonomie)

Pointage automatique par double clic ou tiré-laché, automatiquement

zoom, déplacement, cadrage

Dispositif "pantographe" pour plus de précision et d’ergonomie

Option de marquage des mesures (par numéro ou affichage de la longueur)

Loupe 2 puissances

Copies d'écran partiel ou non

illustrations par barres de références (droites ou obliques) automatiquement étalonnées, texte, etc

Sauvegarde d’une image référencée sans perte de la qualité de l’image originale..

gestion des images

Chargement fichier image

Chargement d'images par blocs dans le chargeur

Gestion des interfaces de capture d'images(scanner, camera, dispositif compatible Twain)

Sauvegarde des images (entière ou cadrage)

Gestion du Chargeur d'images

Chargement des images via le chargeur

Calibrages

calibrages divers

Etalonnage des appareils (microscope, binoculaire etc ..) selon la mire disponible

Etalonnage sur portion d'images

Etalonnage objectif

Prise en compte du grossissement objectif

calibrage par distance ou graduations

calibrage indépendant de la résolution

calibrage indépendant de la taille de l'image

Etalonnage d'un microscope

Etalonnage "sans mire"

Possibilité de recalibrage a posteriori (une ou plusieurs images) en cas d'erreur ou d’oubli

Entrée au clavier d'un coefficient de calibrage ou opération mathématique sur un calibrage existant

Sauvegarde et chargement des différents calibrages/ commentaires

Gestion des fichiers de calibrage séparée pour chaque appareil de capture ou chaque microscope(optionnel)

Mesures élémentaires

Mesures de distances :

- segments

-spores 2D (longueur, largeur)

-spores 3D (longueur, largeur, épaisseur)

-Cystides ( de 3 à 5 mesures)

- Mesure de formes courbes (poils, cystides, spores allantoides etc …) applicable à toutes les mesures ci-dessus

-comptages (simple / comptage des bosses ou des angles des spores)

Comptage possible en cours de mesure (par ex sommets de spores d’entolomes , compter et mémoriser le nombre d'angles …) Mémorisation du résultat dans la grille

Calcul de la densité des pores de polypores etc.

Mesures de surface, de longueurs de contours, d’angles

Mesure des éléments courbes ( par ex cystides, spores allantoides .. pour toutes les fonctions de mesure de dimension)

 Mesure d’angles et de surfaces

forme des spores

 Affichage  du type de spores  leiosporée

Caractérisation des spores par un nouvel indice de forme (Calcul de ("Indice de forme" : publication à paraître)

Recherche automatique et affichage de la spore la plus représentative en vue de publication (spore optimale, c'est-à-dire proche de la moyenne, du mode ou de la mediane )

Grille de mesures

Effacement dernière mesure, effacement d'une mesure quelconque, grille entière

Recherche automatique d'une mesure (Mycomètre recharge automatiquement l'image puis centre la figure sur l'élément mesuré, avec la valeur du zoom du pointage)

Commentaires grilles

Aperçu des résultats / copie dans le presse papier

Notation rapide (différentes notations disponibles)

Calculs élémentaires pendant la mesure

Coefficient L/l, L/e, Volumes de révolution approché (mode 2D) 

Calcul du Volume 3D

Calculs statistiques élémentaires : Moyenne, écart-type de l’échantillon, mini, maxi .Calcul statistiques plus élaborés : écart-type réel ou estimé, déciles, médiane, dissymétrie, kurtosis, dominante…

( pour les distributions multimodes voir aussi PDM dans Diagramme)

Aperçu abrégé des résultats

Illustrations

Illustrations sur image écran ou sur une copie EXACTE de l’image en cours

2 x16 choix de couleurs pour les illustrations

Police et taille des caractères paramétrables

Choix du marquage des éléments mesurés par index ou par valeur numérique de la dimension

Insertion de longueurs de référence sur la zone de travail ( toutes directions)

Insertion de commentaires sur la zone de travail ( polices et dimensions des caractères paramétrables)

Sauvegarde de l’écran de travail

Création d’une copie de l’image source (sans perte de qualité) avec inscription de segments étalons et de commentaires

Gestion de la session

Initialisation

Sauvegarde des paramètres

Fonction de démarrage du module principal paramétrable

Fonction de démarrage du module statistique paramétrable

Sauvegarde automatique de la session (paramétrable)

Sauvegarde de la session, reprise d'une session antérieure

Export : export rapide de notations sous différents formats vers le presse papier

Export de la grille de mesures au format Txt ou CSV (compatible Excel etc ..)

Copies d'écran (diverses options)

Importation de données (depuis un fichier texte, CSV, Excel …)

Options

Langue

Nb de décimales

Mode statistiques par défaut

Réglage du clic de validation

option machines "lentes/rapides"

copies d'écran diverses

grille de mesures

format de l’image exportée

sauvegarde automatique

format de la notation (6 choix)

Fonction de démarrage

Décimales (0,1,2, auto)

Mesure Multicouche (Mode MC)

(prises de vues en profondeur, analyse à la manière d’une tomographie .-La technique de mesure rappelle la mesure manuelle de visu à l’oculaire-

traitement des spores dont un axe parallèle à la table du microscope, spores superposées etc ...)

Gestion du chargeur multicouches

Recadrage automatique des images du chargeur multicouche

Couleur automatique du tracé selon l’image active

Taille de l’image analysée

Mycomètre traite TOUTE image affichable par Windows.

La taille mémoire utilisée pour l’image en cours est celle qui serait nécessaire pour l’affichage par Windows, PLUS la taille de l’écran (négligeable en général)

On peut donc lancer plusieurs sessions de Mycomètre simultanément (pour comparaisons, par exemple)

On n’est donc limité QUE par la mémoire disponible dans la machine , ce qui ne pose pas de problème dans la machine de moins de 20 ans …

MYCOSTATS

Calcul des diverses caractéristiques numériques ‘classiques’ de l’échantillon

(Mini, maxi, moyenne, dominante,écart-type vrai et estimé, dissymétrie, Kurtosis, coefficient de Pearson)

Calcul systématique de la médiane et des déciles

Importation de données externes

Distributions multimodales

Calcul systématique et automatique de la dominante, y compris pour les petits échantillons (article prévu sur l’algorithme original mis en oeuvre)

Recherche et calcul semi-automatique des modes secondaires (jusqu’à 5) pour les distributions multimodales

(expérimenté avec succès dans le cadre de diverses publications)

Nuage de points

Choix des données à afficher (par ex Lxl, Lx, Q …)

Affichage du numéro de mesure

Extraction de sous ensemble de mesures

Export de sous ensemble de mesures

Histogramme (paramétrable)

Affichage des classes

Corrélation

Droites de régression

Ellipse de tolérance

Choix du repère-Choix des axes

Extraction de données du nuage de points , export des trames, traitement séparé d’un extrait de l’échantillon

Diagramme

Traitement des mesures effectuées

Entrées de données au clavier ou via le presse papier

Importation données externes (par ex tableau excel, fichier CSV etc …)

Affichage simple ou cumulatif du diagramme

Echelle automatique ou manuelle

Recherche automatique du Mode (cf PDM)

Recherche automatique des modes multiples

Affichage et traitement séparé de l’ensemble extrait

Copie d‘écran

Copie rapide du résumé dans le presse papier

Choix des variables à afficher (simultanément ou non)

Nombre de classes paramétrable, affichage des limites de classes

Tests statistiques

Test de la moyenne

Comparaison de l’échantillon au type

Comparaison de deux échantillons

Calcul des risques alpha ET beta

Puissance du test

Test de Shapiro-Wilk

Test de Möls

( les résultats des tests sont commentés)

…. Autres test en cours de développement

Tables statistiques

Loi Normale

Loi de Student Fisher

…. Autres tables prévues…

Outils

Sauvegarde de la trame de l’ensemble extrait séparément

(méthode très utile pour séparer et traiter par exemple les distributions de spores mélangées 2-4 sp )

Export du CSV de l’ensemble extrait

Importation d’extraits de fichiers Excel (6 lignes ou en 6 colonnes maximum) pour traitement avec Mycostats

MYCOCHROME

(Module idéal aussi pour les daltoniens : les résultats sont totalement indépendants des qualités de l'écran )

Mesure

Mesure couleur en mode calibré ou non

Etalonnage scanner

Création d’un nuancier virtuel

(Nb : le mode ‘calibré’ n’est pas obligatoire, mais fortement conseillé pour pouvoir comparer ses mesures avec celles d’un autre mycologue)

Utilisation d’un nuancier virtuel téléchargé

interface graphique

Choix de la taille de l’échantillon mesuré

Options mycocharte

Charger un nuancier

Sauver un nuancier

Charger un étalon de couleur

Charger un fichier de calibrage de scanner

Sauvegarder un fichier de calibrage de scanner

Nuanciers : Dagron, Romagnesi, British flora, Munsell , Courtecuisse et Duhem, …

Ajustement

Recherche automatique de la donnée colorimétrique du nuancier la plus proche de la couleur étudiée

Entrée des données mesurées

( Moyenne, première, dernière, ligne au choix, entrée au clavier)

Choix du repère colorimétrique (RVB, CEI Lab* …)

Choix de la norme de calcul de l’écart colorimétrique ( 2 en RVB, 5 en CEILab)

Recherche de couleurs voisines, classement et affichage des écarts

Comparaison visuelle en mode RVB

Copie des résultats dans le presse papier

Comparaison de couleurs de sporées ….

Autre ..

Gestion d’une base de données statistique ( enregistrement, exploitation)

Recherche, dans une base externe, d’une espèce de caractéristiques statistiquement voisine

Stockage des paramètres essentiels dans une base de donnée  .mstat

Affichage des données Exif
Possibilité de documentation simultanée dans une langue supplémentaire (prévu pour les documentations encore indisponibles, russe, ukrainien, basque ...)

Fond d’écran personnel

Sauvegarde de l’image en cours

Importation ex temporane d’une image Twain ou presse-papier

Prévu (en cours de test…)

- Une technique originale facilitant les mesures ..

- autres tables statistiques

- tests paramétriques complémentaires

- tests statistiques non paramétriques

- Mise en oeuvre de la logique floue pour une exploiation systématique et rationnelle des résultats

Prochainement (déjà opérationnel sur ma version personnelle 1.05 )

mesures d'angles

mesures des lamelles

mesures des pores de polypores et des divers hymeniums

Projet à plus long terme

Analyse des Chromatogrames

Caractérisation des formes des spores et autres objets par des techniques numériques avancées