MYCOSTAT : premiers pas

Mycostat est un module de Mycomètre librement utilisable même en version de démonstration.

Attention : cette page n'est qu'un aperçu simplfié à l'extrême des fonctions de mycomètre.

On lira plus de renseignements ici

 

 accès direct aux menus  :  Nuage de points /  Diagramme  /  tests  /  Tables statistiques

voir aussi Mycomètre, premiers pas

Lancement de mycostat :

(Le menu Diagramme s'ouvre par défaut)

Lancer mycomètre (Version V>2.02) et presser le bouton MYCOSTAT

(Il n'est pas obligatoire de lire l'avertissement)

La fenêtre s'ouvre, par défaut, sur la fonction Diagramme .

 

 

 

 

 

 

 

  
L'utilisation decette fonction ne demande aucune connaissance en statistiques : on pourra donc passer directement à l'exemple d'application

Cette fonction est nouvelle. Elle permet l'affichage des diagrammes de distribution et de répartition.

En effet, l'expérience a confirmé que l'utilisation des histogrammes pour des échantillons de faible effectif est un non-sens statistique. En effet, la règle veut que pour utiliser valablement la répartirtion d'une population en classe, aucune classe ne doit avoir un effectif inférieur à 5, ce qui impose, même pour un nombre réduit de classes, un échantillon de taille suffisante. L'utilisation du mode "Histogramme", toujours disponible, est donc tout à fait déconseillé pour des échantillons de moins de 100 individus, et n'a plus vraiment à être utilisé car remplacé très avantageusement par le mode "Diagramme".

Les diagrammes fournis sont très simples :

Diagramme de distribution : sur un axe horizontal, chaque élément de l'échantillon traité est repéré par un point (un petit segment pour être visible).Lorsque l'échantillon est présent plusieurs fois, les segments sont additionnés afin d'obtenir une image représentation caractérisitique de la distribution vraie.

Diagramme de répartition : pour chaque point du diagramme de distribution l'ordonnée est augmentée de 1 unité : on obtient donc une courbe "en escalier" croissant de 0 jusqu'à l'effectif de l'échantillon. Pour un nombre quasinfini de mesures, on obtiendrait une courbe continue.

Dans la zone de texte (en bas et à gauche), les caractéristiques statistiques de la suite des données traitées sont affichiée et exportables.

le PDM

Ce paramètre "nouveau" est très important : le but est de déterminer les points de l'axe horizontal au voisinage desquels la densité est la plus grande . Nous l'avons désigné par Point de Densité Maximale (PDM) qui correspond exactement au "mode" (ou "dominante" ) dans le cas d'un effectif infini.

Une distribution peut être "uni-modale" dans certains cas particuliers, mais dans le cas de sporées comportant des spores de différents types (issues, par exemple, de basides 2- et 4sporiques) cette distribution est "multimodale".

Un opérateur expérimenté sait par habitude repérer et mesurer les spores les plus représentatives. S'il calcule la moyenne de leurs dimensions, il obtient approximativement le mode principal de la distribution, à la condition que cette distribution soit symétrique et uni-imodale.

Le calcul du mode principal est quelque fois possible avec un tableur, mais nous avons constaté que sur des petits échantillons (N< 100), ce calcul n'aboutissait pas toujours.

Par ailleurs la détermination des modes secondaires, qui caractérisent les autres types de spores présentes, est très difficile "de visu", même approximativement, et tout à fait impossible avec un tableur.

Dans Mycostat un algorithme original permet de déterminer ces paramètres ( PDM et PDMS = PDM Secondaire), quelque soit la distribution, y compris pour des échantillons de petite taille (un article exposant les méthodes et les algorithmes sera rédigé ultérieurement). Si l'effectif est important, le PDM égale la Dominante.

L'algorithme n'a jamais failli sur les très nombreux essais sur des résultats de mesures réeelles et des listes synthétiques diverses.

Les autres fonctions, comparaison statistique des moyennes, tables statistiques, ne seront pas présentées dans ce résumé simplifié.

Exemple d'application :

 

Dans le menu "outils", pressez "Exemple" : une véritable série de mesures de spores est affichée et traitée.

 

Les deux diagrammes sont affichés, et les caractérisriques statistiques, dont le PDM, sont affichées. Le PDM est affiché sur le diagramme sous forme d'un trait de couleur violet en dessous de l'axe.

 

  

 

DMS : presser le bouton PDMS qui se colore en vert  

Avec la souris, pointer approximativement deux points de chaque côté de la zone où apparait une autre concentration de valeurs. Les valeurs de ces points limites sont affichées, le PDMS est calculé et affiché (Il peut être nécessaire d'augmanter le nombre de mesure pour confirmer ce "point d'accumulation"). Sur l'axe, le PDM est représenté en vert.

Presser OK pour valider cette valeur qui s'inscrit dans la zone de texte à exporter. On peut chercher jusqu'à 5 PDMS (cette procédure sera remplacée ultérieurement par une autre totalement automatique et contrôlée).

Presser le bouton PDMS pour sortir de la procédure.

Entrée des données

Deux types de données sont actuellement possibles en entrée :

La commutation est automatique ou forcée. Le traitement des données est le même dans tous les cas.

Traitement des mesures : "entrée" se positionne automatiquement sur "Mesures"  

Si vous avez effectué un ensemble de mesures avec Mycomètre, la fonction par défaut de Mycostat est le mode diagramme..

L'ascenceur permet d'afficher successivement les diagrammes des différentes colonnes (selon la fonction de Mycomètre).

L'entête de la colonne est affiché.

Traitement des données externes : positionner "entrée" sur "Texte" (automatique si la grille des mesures est vide)  

Il est possible :

-soit d'entrer les données au clavier dans la ligne d'édition supérieure

les données doivent être séparées par ";"

-soit de coller des données copiées dans un fichier TXT ou CSV

Dans le traitement de texte marquer et Copier la liste des données à traiter et

dans Mycostat presser "copier"

-soit de coller directement des données de lignes ou de colonnes copiées directement dans un tableur

Dans le tableur marquer les cellules à traiter puis dans Mycostat, presser "copier".

Rappel

Lors des mesures toutes les spores doivent être mesurées, sans aucun tri préalable.

Ne doivent être écartées que :

les spores manifestement anormales ou brisées
les spores mal positionnées

les spores manifestement étrangères.

Export des résultats :

-Export possible du contenu de la zone d'édition
-Export des résultats en pressant "copier" au-dessus de la fenêtre résultats. Cette zone peut être éditée pour ajout de commentaires..

 

Nuage de points / histogramme

Voir documentation  de mycomètre V1.xx ou V2.xx

Tables statistiques

tables statistiques actuellement disponibles :

Loi Normale ( directe et réciproque)
Loi de Student-Fisher ( directe et réciproque)


Il existe d'autres possibilités qui seront détaillées dans la documentation générale.